Deteksi Dini dan Klasifikasi Staging Kanker Payudara Menggunakan DNA Methylation Berbasis Multi-Layer Perceptron

Kurniawan, Vincent (2025) Deteksi Dini dan Klasifikasi Staging Kanker Payudara Menggunakan DNA Methylation Berbasis Multi-Layer Perceptron. MBKM thesis, Universitas Multimedia Nusantara.

	PDF HALAMAN_AWAL.pdf Download (612kB)
	PDF BAB_I.pdf Download (349kB)
	PDF BAB_II.pdf Download (493kB)
	PDF BAB_III.pdf Download (601kB)
	PDF BAB_IV.pdf Restricted to Registered users only Download (660kB)
	PDF BAB_V.pdf Download (359kB)
	PDF DAFTAR_PUSTAKA.pdf Download (333kB)
	PDF LAMPIRAN.pdf Restricted to Registered users only Download (3MB)
	PDF LEMBAR_PENGESAHAN.pdf Download (54kB)
	Archive (ZIP) CREATION_FILE.zip Download (719kB)

Abstract

Kanker payudara merupakan salah satu penyebab kematian tertinggi pada wanita, dan diagnosis dini sangat penting untuk meningkatkan tingkat kelangsungan hidup. Penelitian ini bertujuan untuk membangun model deteksi dan klasifikasi stadium kanker payudara berdasarkan pola metilasi DNA menggunakan algoritma Multi- Layer Perceptron (MLP). Data yang digunakan berasal dari basis data TCGA-BRCA dan mencakup informasi DNA methylation Illumina 450K serta data klinis pasien. Fitur dipilih melalui kombinasi metode Limma, MethylSuite, dan Recursive Feature Elimination (RFE), dengan fokus pada identifikasi biomarker yang paling signifikan. Arsitektur MLP dirancang dalam dua konfigurasi: sederhana dan kompleks, dan model dievaluasi menggunakan metrik seperti akurasi, precision, recall, dan F1-score. Hasil menunjukkan bahwa kombinasi MethylSuite dan RFE dengan 100 CpG sites menghasilkan performa terbaik (akurasi 96,5%) dibandingkan metode lain. Penerapan SMOTE juga terbukti meningkatkan kinerja model pada dataset tidak seimbang. Namun, evaluasi pada populasi kulit hitam menunjukkan adanya bias, dengan penurunan drastis akurasi hingga 22%. Hal ini menekankan pentingnya representasi data yang adil dalam pembangunan model medis. Penelitian ini menunjukkan potensi besar penggunaan analisis metilasi DNA dan deep learning untuk personalisasi diagnosis kanker payudara.

Item Type:	Thesis (MBKM)
Keywords:	kanker payudara, DNA methylation, Multi-Layer Perceptron, klasifikasi stadium .
Subjects:	?? T58.5-58.64 ??
Divisions:	Faculty of Engineering & Informatics > Informatics
SWORD Depositor:	Administrator UMN Library
Depositing User:	Administrator UMN Library
Date Deposited:	18 Jul 2025 13:09
Last Modified:	18 Jul 2025 13:09
URI:	https://kc.umn.ac.id/id/eprint/39016

Actions (login required)

View Item