Asosiasi Single Nucleotide Polymorphism dan Fenotipe pada Penyakit Ginjal Kronis Menggunakan Metode Elastic Net

Zerlina Oktaviani, Maureen (2023) Asosiasi Single Nucleotide Polymorphism dan Fenotipe pada Penyakit Ginjal Kronis Menggunakan Metode Elastic Net. Bachelor Thesis thesis, Universitas Multimedia Nusantara.

[img]
Preview
PDF
HALAMAN_AWAL.pdf

Download (1MB) | Preview
[img]
Preview
PDF
DAFTAR_PUSTAKA.pdf

Download (233kB) | Preview
[img]
Preview
PDF
BAB_I.pdf

Download (235kB) | Preview
[img]
Preview
PDF
BAB_II.pdf

Download (267kB) | Preview
[img]
Preview
PDF
BAB_III.pdf

Download (1MB) | Preview
[img] PDF
BAB_IV.pdf
Restricted to Registered users only

Download (430kB)
[img]
Preview
PDF
BAB_V.pdf

Download (216kB) | Preview
[img] PDF
LAMPIRAN.pdf
Restricted to Registered users only

Download (912kB)

Abstract

Ginjal merupakan salah satu organ penting dalam tubuh manusia yang berperan besar dalam penyaringan darah pada sistem metabolisme tubuh sehingga apabila rusak dapat mengakibatkan Penyakit Ginjal Kronis (PGK). Untuk meminimalisir masalah kesehatan PGK ini, dibutuhkan suatu pengobatan yang lebih mutakhir dengan pengobatan yang sudah ada saat ini, salah satunya adalah dengan precision medicine yang dikembangkan berdasarkan lingkungan, gaya hidup, genetik, serta keragaman fenotipe suatu individu. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) dapat digunakan sebagai bentuk variasi genetik yang dapat diamati kaitannya dengan fenotipe PGK. Untuk menganalisis asosiasi antara SNP dan fenotipe pada PGK diperlukan bantuan algoritma machine learning yang dapat mengolah data dengan dimensi yang banyak, salah satunya dengan menggunakan metode Elastic Net. Pada penelitian ini, akan digunakan metode Elastic Net untuk mengasosiasikan SNP dengan fenotipe untuk PGK karena metode Elastic Net mampu mengatasi masalah curse of dimensionality. Berdasarkan hasil yang didapatkan pada penelitian ini, menunjukkan metode Elastic Net dapat menyeleksi 88 SNP signifikan dengan nilai MAE yang rendah yaitu 0.755 dan koefisien determinasi (R2) yang baik yaitu 0.999. Adapun SNP signifikan yang terpilih dengan model Elastic Net antara lain Rhd, F2, Col1a1, Nos3, F5, Gypc, F8, F10, Bcam, Rbp4, Plg, Thpo, Myh9, Akt1, Fgb, dan F7.

Item Type: Thesis (Bachelor Thesis)
Keywords: Asosiasi, Elastic Net, fenotipe, Penyakit Ginjal Kronis (PGK), Single Nucleotide Polymorphism (SNP)
Subjects: 600 Technology (Applied Sciences) > 600 Technology > 600 Technology
Divisions: Faculty of Engineering & Informatics > Informatics
SWORD Depositor: Administrator UMN Library
Depositing User: Administrator UMN Library
Date Deposited: 28 Jun 2023 09:47
Last Modified: 08 Aug 2023 03:16
URI: https://kc.umn.ac.id/id/eprint/25511

Actions (login required)

View Item View Item